单细胞转录组
1,技术简介
单细胞转录组测序技术基于微流控技术的单细胞文库制备系统,可以同时获得100-80,000个单细胞文库,通过高通量测序实现对数百个至数万个细胞进行细胞鉴定和基因表达分析。10x Genomics单细胞转录组测序广泛应用于多种细胞类型,如干细胞、肿瘤细胞、免疫细胞、生殖细胞、胚胎细胞等,是研究免疫细胞群体、肿瘤异质性、和胚胎发育等最佳选择之一。
2,技术流程
3,样本准备
样本类型 | 组织 | 细胞 | 血液 |
样本要求 | ≥100mg | ≥10^6 | ≥1ml |
目前我司可对新鲜血液样本、植物样本、临床组织样本进行单细胞转录组和单细胞免疫组库(TCR或BCR,TCR和BCR)及空间转录组进行分析。
4,生信分析流程
5 主要结果展示(只展示标准分析部分,具体项目具体分析,详细请咨询区域技术推广专员)
1.测序结果统计 | 8. 特异marker基因差异分析 |
2.数据质控统计 | 9. 样本间相同cluster基因差异分析 |
3.比对结果统计 | 10. cluster差异表达基因GO功能分析 |
4.基因表达定量分析 | 11. cluster差异表达基因Pathway功能分析 |
5. Marker基因鉴定 | 12. cluster差异表达基因TF编码能力预测 |
6. 细胞类型注释 | 13. cluster差异表达基因蛋白互作分析 |
7. 单样本/多样本细胞聚类分析 | 14. cluster基因相关性网络分析 |