10x单细胞免疫组库(BCR/TCR)
1,技术简介
10x单细胞免疫组库是一种在单个细胞水平,同时对转录组基因表达和适应性免疫受体库进行高通量测序的新技术,为免疫调控研究提供了更具扩展性的平台,可以同时获取5’基因表达的数据和 TCR/BCR 的VDJ 全长序列。是一种高效的同时检测表达和免疫组库的技术,在肿瘤微环境、感染性疾病、免疫治疗等研究领域中有着极为广泛的应用。
2,技术流程
3,样本准备
样本类型 | 组织 | 细胞 | 血液 |
样本要求 | ≥100mg | ≥10^6 | ≥1ml |
4,生物信息学分析流程
5,主要结果展示(只展示标准分析部分,具体项目具体分析,详细请咨询销售):
1. 测序结果统计 | 8. 特异marker基因差异分析 |
2. 数据质控统计 | 9. 样本间相同cluster基因差异分析 |
3. 比对结果统计 | 10. cluster差异表达基因GO功能分析 |
4. 基因表达定量分析 | 11. cluster差异表达基因Pathway功能分析 |
5. Marker基因鉴定 | 12. cluster差异表达基因TF编码能力预测 |
6. 细胞类型注释 | 13. cluster差异表达基因蛋白互作分析 |
7. 单样本/多样本细胞聚类分析 | 14. cluster基因相关性网络分析 |
RACE mRNA-Seq文库信息分析内容(免疫组库分析):
1.测序结果统计 | 5.TCR/BCR文库信息分析内容 |
2.数据质控统计 | 6.数据处理与质控分析 |
3.比对结果统计 | 7.免疫组库细胞克隆型分析 |
4.基因表达定量分析 |