Small RNA测序
1,技术简介
Small RNA是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用,包括miRNA、piRNA和siRNA。其中miRNA通过与靶mRNA特异性结合调控靶mRNA的表达,从而参与许多生命过程,如细胞增殖、 细胞凋亡、脂肪代谢和细胞分化等。Small RNA(sRNA)测序是利用高通量测序平台检测已知和未知miRNA的表达水平及其表达差异,结合同一样本的转录组测序数据进行联合分析,可以同时分析miRNA及其靶基因的表达情况,为研究small RNA功能及调控机制提供有力手段。
2,技术路线
3,样本准备
样本类型 | 组织样品 | RNA |
样本量 | 动物组织:> 2g; | 总RNA≥3µg, |
植物组织:> 4g; | 浓度≥50ng/µI, | |
培养细胞:> 1×107 个; | OD260/280≥1.8-2.2, | |
血液样品:≥ 2ml | OD260/230≥2.0 | |
送样要求 | 送样时请标记清楚样品编号,管口使用Parafilm膜密封; | |
样品保存期间切忌反复冻融 | ||
处理方式 | 取样后直接速冻 | |
运输方式 | 干冰寄送 |
4,生信分析流程
5,主要结果展示