高通量测序技术

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蛋白质组学样品准备及寄送指南

一、蛋白质组学样品准备的一般原则

1.确保样品状态良好,符合预期的表型或分子指标。

2.带手套、口罩、头套进行操作,避免角蛋白污染。

3.保证取材后的操作在冰上进行,并尽量操作迅速。

4.依后续实验需求,做好分装,避免蛋白反复冻融。

5.取材后,液氮速冻,- 80 ℃ 冰箱保存,干冰寄送。

二、蛋白质组学服务项目对样品量的要求
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1.银染或考染胶条:需条带肉眼清晰可见。

2.细胞:蛋白质组学项目需1×106或体积>30 μL;磷酸化蛋白质组学项目需1×107

3.动物组织:蛋白质组学项目需鲜重100 mg;磷酸化蛋白质组学项目需500 mg。

4.植物组织:蛋白质组学项目需鲜重200 mg;磷酸化蛋白质组学项目需1 g。

 备注:对于蛋白得率较低的样品,建议在条件允许的情况下,适当提高样品送样量;特殊样品,请联系公司技术人员协商送样量。

三、常见类型样品的准备流程

1.胶条样品:将蛋白条带用干净的刀片切下,并切割为1 mm3的小块,装入进口EP管中及时送样,送样时需加冰袋维持低温。

2.蛋白溶液样品:最好测定蛋白浓度后,干冰寄送液氮速冻的蛋白溶液(需指明缓冲液成分和浓度);或将蛋白通过TCA法或丙酮法沉淀,晾干后,干冰或冰袋寄送。

3.细胞、细菌、真菌样品:用预冷的PBS缓冲液清洗三次,去除培养基残留成分,清洗结束后,离心将上清弃去,液氮速冻后,-80 ℃保存,或干冰寄送。

4.动物组织样品:取材后冰上操作,迅速将组织剪成长宽高分别为0.5 cm的小块,用预冷PBS清洗三遍,去除残留血液,称重后,液氮速冻,-80 ℃保存,或干冰寄送。

5.植物组织样品:新鲜取材后,用预冷的PBS将材料表面污物去除,称重后,液氮速冻,-80 ℃保存,或干冰寄送。

6.培养基上清液:培养细胞至合适密度,用无血清培养基清洗三遍后,加入无血清培养基继续培养合适时间,收集培养上清,离心去除细胞后,使用0.22 μm的滤膜过滤,液氮速冻后,-80 ℃保存,或干冰寄送。

7.血液样品:血液样品一定避免溶血,要求采集血液时同时制备为血清或者血浆样品,建议使用相应的采血管,之后通过离心的方式获得血清或血浆,按需求分装后,液氮速冻,-80 ℃保存,或干冰寄送。

8.IP样品:关于IP样品制备与注意事项,可向我司索取“IP-MS实验指南”。

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