空间转录组揭秘内皮 EphA4 缺失通过 Wnt 通路调控创伤性脑损伤后血脑屏障通透性

2026-08-27

今天分享一篇 2026 年 8 月在线发表于神经病理顶刊《Acta Neuropathologica Communications》的文章,DOI:10.1186/s40478-026-02394-9,文章主要聚焦创伤性脑损伤(TBI)后血脑屏障(BBB)损伤的空间分子机制,创新性整合空间转录组学与双示踪剂示踪技术,锁定内皮 EphA4 是调控 BBB 完整性的关键负向调控因子,下游 Wnt/β-catenin 通路是极具潜力的 TBI 治疗靶点。


文章标题:空间转录组揭秘内皮 EphA4 缺失通过 Wnt 通路调控创伤性脑损伤后血脑屏障通透性


期刊:Acta Neuropathologica Communications(JCR 分区:Q1)IF: 6.5

研究背景



创伤性脑损伤(TBI)是造成神经功能缺损的首要诱因,除原发撞击损伤外,氧化应激、神经炎症、血脑屏障(BBB)破坏构成的继发性损伤级联反应,会持续加重脑组织损伤,诱发长期认知衰退。 

BBB 完整性失衡是 TBI 核心病理特征,但传统研究存在两大短板:

1.  传统 bulk RNA 测序丢失组织空间位置信息,无法区分损伤核心、周边半损伤区的分子异质性;


2.  单一示踪剂(伊文思蓝 EBD)仅能检测大分子渗漏,无法区分不同分子量物质的通透性时序差异,难以精准量化 BBB 损伤程度。

既往研究提示 EphA4 受体参与中枢损伤应答,但血管内皮特异性 EphA4如何调控损伤后 BBB 功能、下游分子通路完全未知。


本文研究者们通过构建内皮特异性 EphA4 敲除小鼠(EphA4f/f  VE-Cadherin-CreERT2,KO),联合小分子荧光素钠(NaFl,<1 kDa)伊文思蓝(EBD,~67 kDa)内源 IgG(150 kDa)三重示踪体系,搭配 Visium 空间转录组,解析 TBI 后 BBB 时空损伤规律与 EphA4-Wnt 调控轴。

实验模型与技术体系



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基因编辑小鼠模型

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野生对照组(WT):EphA4f/f


内皮特异性敲除组(KO):EphA4f/f VE-Cadherin-CreERT2,他莫昔芬腹腔注射 5 天诱导内皮 EphA4 敲除,间隔 2 周后实施控制性皮层撞击损伤(CCI,经典 TBI 造模手段);


实验动物:8–10 周雄性 CD1 小鼠,排除雌激素对血管、免疫的干扰。

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三重示踪 BBB 通透性检测体系

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静脉联合注射两种外源性示踪剂:

1.  荧光素钠 NaFl(小分子,<1 kDa):检测轻度、持续性 BBB 渗漏;


2. 伊文思蓝 EBD(结合白蛋白,~67 kDa):检测重度、急性期大分子渗漏; 取材同步进行内源 IgG 免疫荧光染色(150 kDa),反映损伤区滞留血液蛋白; 造模后 1、4、7、14 天(dpi)取材,共聚焦成像 + 立体计量法量化皮层、海马示踪剂渗漏体积。

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空间转录组与药理学干预

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10x Visium 空间转录组解析损伤皮层原位基因表达; 通路验证药物:

FZM1:FZD4 拮抗剂,抑制 Wnt 通路;


FZM1.8:FZD4 选择性激动剂,特异性激活内皮 Wnt/β-catenin。

核心研究结果



一、野生型小鼠 CCI 创伤后,BBB 修复存在严格的分子量依赖性时序动态规律

研究人员对 WT 小鼠分别在损伤后 1、4、7、14 天收取脑组织,通过 NaFl、EBD、IgG 三重标记量化不同分子量物质的血管外渗体积,完整还原 BBB 从破损到修复的全过程:


1.损伤后 1 天(1dpi,损伤急性期峰值):

同侧损伤皮层中 IgG、EBD、NaFl 三种示踪剂均出现大面积、高体积外渗,共聚焦图像可见损伤核心区荧光信号完全弥散,代表 BBB 细胞旁通道、跨胞转运通路全面开放,大、中、小分子物质均可自由穿透血管壁;对侧正常皮层几乎无任何示踪剂渗漏,作为阴性对照基线。

2.损伤后 4 天(4dpi,亚损伤早期):

大分子示踪剂渗漏出现明显分层修复:EBD(67kDa)与内源 IgG(150kDa)外渗体积相比 1dpi 大幅下降,说明血管对大分子物质的屏障功能开始恢复;但小分子 NaFl(<1kDa)渗漏量与 1dpi 无统计学差异,皮层内持续存在弥散绿色荧光,提示血管微孔、跨胞囊泡转运仍处于亢进状态,轻度渗漏持续存在。

3.损伤后 7 天(7dpi,亚损伤晚期):

EBD 完全无法穿透血管,损伤皮层无紫红色荧光,代表大分子屏障基本修复;IgG 仍能检测到微弱红色信号,但并非新鲜渗漏,而是损伤早期漏出的 IgG 蛋白长期滞留于损伤脑组织基质中;NaFl 小分子渗漏依旧显著,是 7 天内唯一持续存在的通透性缺陷。

4.损伤后 14 天(14dpi)

NaFl 外渗完全消失,三种示踪剂信号均回归基线水平,BBB 完整屏障功能才彻底恢复。

该组结果直接推翻仅依靠伊文思蓝评估 BBB 的传统实验逻辑:

仅检测 EBD 会误判 7dpi 时 BBB 已完全修复,忽略小分子持续渗漏带来的长期神经炎症、神经元损伤风险,证明多分子量梯度示踪体系是精准评估 TBI 后血管损伤的必备手段。


Figure 1

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图1. 内皮特异性敲除 EphA4 小鼠构建策略

二、内皮特异性 EphA4 敲除(KO)可分层减轻皮层、海马的全时相血管渗漏,兼具急性期保护与亚急性期加速修复作用

研究同步量化同侧损伤皮层、海马两大关键脑区的示踪渗漏,分时间点对比 WT 与 KO 小鼠的通透性差异,且通过空间转录组成像验证内皮 EphA4 敲除模型构建成功:

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模型有效性验证

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空间转录组 EphA4 表达热图显示:WT 小鼠损伤半球皮层、海马、丘脑血管富集区域均有高强度 EphA4 转录信号;KO 小鼠全脑 EphA4 转录丰度显著下调,血管区域几乎无阳性信号,证实他莫昔芬诱导的内皮特异性敲除效率达标,可用于后续功能实验。

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损伤皮层通透性对比(1/4/7dpi)

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1)急性期 1dpi:KO 小鼠 EBD、IgG 外渗体积显著低于 WT,小分子 NaFl 两组无统计学差异。说明内皮 EphA4 缺失可快速抑制急性期大分子血管破裂、重度渗漏,但无法立刻阻断小分子瞬时通透;


 2)亚急性期 4dpi:KO 组 NaFl、EBD、IgG 三类示踪剂渗漏全部显著低于 WT,大、小分子屏障同步改善; 3)亚急性期 7dpi:WT 小鼠 NaFl 依旧大量外渗,而 KO 小鼠 NaFl 渗漏量大幅下降,证明 EphA4 敲除能显著加速小分子屏障修复,缩短持续性渗漏窗口。

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海马区同步获益(记忆关键脑区)

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BBB 渗漏不局限于撞击原发皮层病灶,会扩散至毗邻海马组织,而海马损伤直接关联 TBI 后长期认知衰退:

 1dpi、4dpi 时 KO 小鼠海马 NaFl 小分子渗漏显著低于 WT;7dpi 两组海马 NaFl 渗漏无差异。


提示内皮 EphA4 缺失能在损伤早期保护海马微血管,减少小分子持续渗漏诱发的海马神经炎症、突触损伤,为改善远期认知功能提供结构基础;

海马区 EBD、IgG 渗漏在 WT 与 KO 之间无显著差异,说明 EphA4 对海马血管的保护作用特异性针对小分子通透通路。

三、空间转录组分区域解析:内皮 EphA4 缺失重塑损伤皮层原位转录图谱,Wnt 通路是核心上调信号轴

研究将损伤脑组织手动划分 4 类功能感兴趣区(ROI)

EBD 阳性重度损伤区、NaFl 阳性轻度渗漏区、同侧无渗漏皮层、对侧健康皮层,结合 UMAP 聚类、差异基因(DEG)、GO 富集、特征基因热图多维度解析分子变化:


Figure 2

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图 2. WT/KO 损伤皮层空间转录组全局分析,差异基因火山图、DEG 数量韦恩图、Wnt 通路富集弦图、BBB 关键基因热图、Srf 空间表达特征图


1. UMAP 聚类证实渗漏分区存在完全独立的转录程序

所有空间测序斑点依据所属 ROI 自动分群,EBD 区、NaFl 区、同侧正常皮层、对侧健康皮层聚类边界清晰,证明不同 BBB 损伤程度的脑组织拥有完全异质性的基因表达特征,普通混合组织测序会掩盖区域特异性分子变化。


2. KO 小鼠损伤皮层紧密连接、血管稳定相关基因整体性上调

对比 WT 与 KO 同侧损伤皮层的差异基因,KO 组内皮屏障功能核心转录本显著升高:

1)紧密连接蛋白家族:Cldn1、Ocln、Tjp2、Tjp3,直接封堵内皮细胞旁间隙;


2)跨胞转运抑制基因 Mfsd2a:减少囊泡介导的小分子跨血管渗漏;


3)内皮稳定转录因子 Srf:空间特征图可见,未损伤小鼠 Srf 基础表达极低,CCI 损伤后 WT 皮层 Srf 轻度上调,KO 皮层 Srf 表达进一步显著升高;Srf 可调控内皮细胞骨架重构,加固血管内皮完整性。

Figure 3

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图 3. 基于示踪渗漏划分脑组织损伤感兴趣区(ROI);分区转录组 UMAP 分群、上下调基因韦恩图、不同损伤区域 GO 富集气泡图、分区关键差异基因热图




3. 神经保护基因上调,氧化损伤、星形胶质过度活化基因下调

研究发现,保护性转录因子 Npas4、Nr4a1 在 KO 皮层显著升高,二者可抑制神经元凋亡、调控应激适应、减轻小胶质细胞过度炎症激活;

金属硫蛋白 Mt1、Mt2、Mt3 表达显著降低,该家族蛋白会抑制 Wnt 通路 β-catenin 核转运,Mt 下调直接解除对 Wnt 信号的抑制;

重度损伤 EBD 区星形胶质活化标志物 Vim、Gfap 在 KO 组织表达下降,提示内皮 EphA4 缺失可缓解损伤诱导的反应性星形胶质增生,减少胶质瘢痕形成。


4. 不同渗漏分区具备独特分子损伤特征,EphA4 缺失同步修复两类损伤微环境

Figure 4

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图 4. WT/KO 的 EBD 阳性损伤区、NaFl 渗漏区相较于正常皮层的差异基因与 GO 富集环形图;KO 与 WT 分区分子通路直接对比


研究发现,EBD 阳性重度损伤核心区存在WT 样本高表达血红蛋白、出血相关基因(Hbb-bs、Hba-a2),突触传递、神经元可塑性基因(Snap25、Camk2a、Sparcl1)显著下调,这代表出血、神经元功能重度受损;


KO 该区域突触相关基因表达回升,血管损伤相关转录本降低;NaFl 阳性轻度渗漏周边区,WT 样本富集炎症、应激基因 Gfap、Fos、Ptx3,神经元记忆相关 Calb1 下调;


KO 该区域 Npas4、Nr4a1 等适应性应激基因显著上调,促炎通路 Serpina3n、Slc38a1 表达下降,炎症微环境得到缓解;


 GO 富集分析证实,EBD 区核心通路集中于血管破裂、组织重塑、神经元凋亡;NaFl 区通路富集于突触组装、膜电位调控、慢性炎症;内皮 EphA4 敲除可同时改善两种区域的有害转录程序,促进神经血管单元修复。


5. Wnt 信号通路是 KO 小鼠最显著富集的上调通路

KO 损伤皮层大量 Wnt 通路配体(Wnt7a、Wnt9a、Wnt10b)、膜受体(Fzd1、Fzd4)、共受体 Lrp1 表达显著高于 WT;

免疫荧光共染 CD31(内皮标志物)与 FZD4 证实:FZD4 蛋白特异性定位在脑微血管内皮细胞,确定内皮细胞 Wnt 通路是 EphA4 缺失的下游核心效应轴。


四、双向药理学干预完整验证:FZD4/Wnt/β-catenin 通路介导内皮 EphA4 缺失带来的 BBB 保护表型

研究采用 “通路抑制 + 通路激活” 正反两套药物实验,直接因果验证 Wnt 通路的功能作用,同时检测血管 β-catenin(Wnt 通路活性标志物)表达水平:

Figure 5

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图 5. EC特异性EphA4敲除内皮细胞中Wnt信号通路的调控影响CCI损伤后的血脑屏障完整性及病灶体积


首先是通过FZD4 拮抗剂 FZM1 处理 KO 小鼠,完全逆转血管保护效应。

研究者们在CCI 造模后 1dpi(损伤峰值时间点)对 KO 小鼠尾静脉注射 FZM1(FZD4 别构抑制剂,阻断内皮 Wnt 信号),设置溶剂对照组:

1)血管 β-catenin 定量染色:KO 溶剂组 CD31 + 血管内 β-catenin 荧光丰度显著高于 WT;FZM1 处理后 KO 小鼠血管 β-catenin 表达大幅下降,Wnt 通路活性被有效抑制;

2)病灶体积检测:FZM1 给药组皮层坏死病灶体积显著大于溶剂对照组;

3)IgG 渗漏成像:FZM1 处理后损伤皮层 IgG 大面积外渗,BBB 重度破损,原本内皮 EphA4 敲除带来的血管保护作用完全消失。 该结果证明:EphA4 敲除后的全部 BBB 保护效应,完全依赖 FZD4 介导的 Wnt/β-catenin 信号激活。

Figure 6

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图6. CCI损伤后,Frizzled 4(FZD4)受体抑制剂Fzm1可减轻血管β-连环蛋白的表达


随后研究者们通过FZD4 选择性激动剂 FZM1.8 处理 WT 小鼠,独立模拟血管保护效果。

他们对普通 WT 创伤小鼠给予 FZM1.8(内皮特异性 FZD4 激动剂,激活 Wnt 通路),溶剂为对照:

1)BBB 通透性量化:FZM1.8 处理组 NaFl 小分子、IgG 大分子外渗体积均显著低于对照组,血管渗漏全面减轻;


2)病灶体积统计:给药组皮层损伤坏死体积显著缩小,继发性脑组织损伤被显著抑制;


3)病理荧光图直观可见:FZM1.8 组损伤区示踪剂荧光弥散范围大幅收缩。

该实验直接证明:

仅激活内皮 FZD4/Wnt 通路,无需敲除 EphA4,即可独立实现稳定 BBB、减轻 TBI 继发性损伤的治疗效果,为临床靶向药物开发提供直接依据。

Figure 7

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图7. 使用Frizzled 4(FZD4)受体激动剂激活Wnt信号通路,可保护血脑屏障的完整性,并减少病灶体积

研究创新与局限性



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核心创新点

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技术创新:建立双示踪剂 + 空间转录组联用体系,把 BBB 通透性功能表型和原位转录组精准对应,解决传统方法空间分辨率不足的痛点;


机制创新:首次明确内皮特异性 EphA4 是 TBI 后 BBB 损伤的关键驱动因子,并完整阐明 EphA4-FZD4/Wnt 调控轴;


转化创新:证实 FZD4 激动剂可作为 TBI 候选药物,仅靶向内皮 Wnt 通路,副作用更低。

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研究局限性

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1.  药物仅在损伤急性期给药,未探究亚急性、慢性期给药的长期修复效果;


2.  Visium 单捕获斑点包含多种细胞,无法将转录变化精准归因于内皮、周细胞、星形胶质单一细胞;


3.  仅用雄性小鼠实验,未验证性别差异;


4.  示踪渗漏仅反映通透性,未电镜验证紧密连接超微结构改变。



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