联合分析专题(六):微生物多样性+代谢组联合分析的研究思路

2023-12-13

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微生物多样性+代谢组联合分析

微生物多样性组成谱测序以细菌或者古菌 16S rRNA 基因可变区、真菌 18S rRNA 基因可变区或真菌 ITSInternaltranscribed spacer)内转录间隔区等微生物特征序列(Signature sequence)或者某些特定功能的基因位点(功能基因或扩增子)为靶位点,通过检测序列的变异和数量,反映菌群中各类微生物物种的身份和丰度,从而快速了解菌群物种分布特征,阐明样本间多样性和组成差异,进而发现差异相关物种

代谢组学是生物体被扰动后(如基因改变或环境改变),通过对生物体内所有小分子代谢物进行定性定量分析,发现其代谢物种类/数量及其变化规律,并寻找代谢物与生理病理变化相对关系的科学。通过对比实验组和对照组的代谢产物来寻找有意义的差异代谢物。

整合微生物多样性与代谢组学数据,可以揭示菌群与代谢物之间的相关性,筛选存在差异的关键菌株。

联合分析思路(技术路线):

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结果展示(微生物部分结果图展现):

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代谢组部分结果图展现:

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