转录组+表观遗传联合分析
转录组是研究功能基因的利器,通过转录组测序可以得到大量差异基因和众多调控网络,围绕转录组开展的多组学分析策略已是多种类型高分文章的必备“法宝”。但是单一的转录组难以确定关键途径,也无法鉴定控制关键途径的结构。
染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)是一种适用于研究蛋白质与生物体细胞中 DNA 相互作用的经典方法,将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段,研究体内转录因子和靶基因启动子区域直接相互作用的方法,对于调控蛋白在基因组上的结合靶点筛选、差异化表观遗传变异的原理揭示提供了重要的解决思路。
通过表观遗传学与转录组联合分析,可以实现表观层面的变化对基因的调控模式。
联合分析思路(技术路线):
结果展示(转录组部分结果图展现):
表观遗传部分结果图展现: