表观基因组学+转录组学联合分析
DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质,但是近些年新的研究表明,生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的,比如科学家们发现,可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种改变不仅可以影响个体的发育,而且还可以遗传下去。这种在基因组的水平上研究表观遗传修饰的领域被称为“表观基因组学”。表观基因组学使人们对基因组的认识又增加了一个新视点:对基因组而言,不仅仅是序列包含遗传信息,而且其修饰也可以记载遗传信息。DNA甲基化改变通常发生在癌症中,并参与肿瘤的发生和进展。异常启动子CpG甲基化为癌症中抑癌基因和癌基因的调控提供了一种选择性机制,而不是基因突变。然而,与基因突变相比,这些甲基化变化本质上可以被药物逆转。因此,表观遗传调节基因的鉴定为表观遗传治疗和新药物靶点的发现开辟了新途径。
转录组广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。目前单一的转录组研究难以在众多组学研究中“脱颖而出”,转录组结合其它组学开展相关研究已经是高分文章的必备工具之一了。
使用表观基因组学与转录组学联合分析,是用来探究表观遗传机制和解析各种生理和病理过程的重要利器。相关文章推荐:An integrated epigenomic-transcriptomic landscape of lung cancer reveals novel methylation driver genes of diagnostic and therapeutic relevance. DOI: 10.7150/thno.58385.
联合分析思路(技术路线):
结果展示(表观基因组学部分结果展示):
表观遗传与转录组学联合分析部分结果: